Instituto Max Planck de Biología Celular Molecular y Genética, Alemania
P: ¿CUÁL ES EL ENFOQUE DE SU INVESTIGACIÓN DE LABORATORIO?
A: El laboratorio está dividido 50 / 50 entre investigación proteómica y lipidómica. Mientras trabajamos en el análisis de proteínas, como identificar redes de interacción de proteínas o caracterizar los proteomas de organismos que están relacionados muy distantemente con organismos con genomas secuenciados, también intentamos cuantificar mejor el lipidoma de varios orgánulos, células y tejidos.
P: ¿CUÁLES SON SUS OBJETIVOS PRINCIPALES?
A: En lipidómica, forjamos la alianza con la biología del desarrollo. El objetivo principal del grupo es combinar lipidómica con biología del desarrollo. A medida que los organismos crecen y se desarrollan a partir de una sola célula, los tejidos recientemente diferenciados requieren su propia composición única de lípidos de membrana. Esperamos caracterizar estos cambios a medida para comprender mejor cómo los defectos hereditarios en el metabolismo de los lípidos causan enfermedades. Estamos igualmente interesados en los lipidomas de microdominios de membrana y la importancia biológica de su notable complejidad.
P: ¿POR QUÉ INCORPORARON EL TRIVERSA NANOMATE?® EN SU LABORATORIO?
A: Necesitábamos capacidades automatizadas de infusión directa de nanoflujo. La lipidómica de escopeta se basa en tasas de flujo bajas y estables, y el TriVersa NanoMate® tiene esta capacidad demostrada. Hemos comprado tres instrumentos adicionales porque nos permiten cambiar rápidamente entre lípidos y análisis proteómico.
P: ¿TIENES ALGUNA PUBLICACIÓN DE PRESENTACIONES UTILIZANDO TRIVERSA NANOMATE?®?
Destacado de la publicación
2021: La lipasa sensible a hormonas combina el metabolismo de los esteroles intergeneracionales para lograr el éxito reproductivo
Christoph Heier es autor correspondiente, Oskar Knittelfelder, Harald F Hofbauer, Wolfgang Mende, Ingrid Pörnbacher, Laura Schiller, Gabriele Schoiswohl, Hao Xie, Sebastian Grönke, Andrej Shevchenko, Ronald P Kühnlein
La lipasa sensible a hormonas (Hsl) se identificó como un regulador ancestral de la degradación de SE, que mejora la transferencia de esteroles intergeneracionales y el éxito reproductivo en las moscas.
Otras publicaciones
- Knittelfelder, O., Prince, E., Sales, S., Fritzsche, E., Woehner, T., Brankatschk, M., Shevchenko, A. (2020) Esteroles como marcadores dietéticos para Drosophila melanogaster. BBA - Biología molecular y celular de lípidos, 1865 (7), 1388-1981. DOI: 10.1016 / j.bbalip.2020.158683
- Trautenberg, LC, Knittelfelder, O., Hofmann, C., Shevchenko, A., Brankatschk, M., Prince, E. (2020) Cómo utilizar el desarrollo de larvas individuales de Drosophila como sensor metabólico. Revista de biología de insectos, 126, 0022-1910. DOI: 10.1016 / j.jinsphys.2020.104095
- Wang, Y., Hinz, S., Uckermann, O., Hoenscheid, P., von Schoenfels, W., Burmesiter, G., Hendricks, A., Ackerman, JM, Baretton, GB, Hampe, J., Brosch , M., Schafmayer, C., Shevchenko, A., Seissig, S. (2020) Caracterización basada en la lipidómica de escopeta del panorama del metabolismo de los lípidos en el cáncer colorrectal. BBA - Biología molecular y celular de lípidos, 1865 (3), 1388-1981. DOI: 10.1016 / j.bbalip.2019.158579
- Finkelstein, S. Gospe III, SM, Schuhmann, K., Shevkenko, A., Arshavsky, VM, Lobanova, ES (2020) Perfil de fosfoinositida de la retina del ratón. Celdas 9 (6), 1417. DOI: 10.3390 / cells9061417
- Brankatschk, M., Gutmann, T., Knittelfelder, O., Palladini, A., Prince, E., Grzybek, M., Brankatschk, B., Shevchenko, A., Coskun, U., Eaton, S. ( 2018) Un cambio en la preferencia de alimentación dependiente de la temperatura mejora el desarrollo y la supervivencia de las drosphila en el frío. Célula de desarrollo, 46, 6, 781-793.e4. DOI: 10.1016 / j.devcel.2018.05.028
- Fernández, C., Sandin, M., Sampaio, JL, Almgren, P., Narkiewicz, K., Hoffmann, M., Hedner, T., Wahlstrand, B., Simons, K., Shevchenko, A., James , P., Melander, O. (2013) Composición de lípidos plasmáticos y riesgo de desarrollar enfermedad cardiovascular. Más uno. DOI: 10.1371 / journal.pone.0071846
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- Carvalho, M., Sampaio, JL, Palm, W., Brankatschk, M., Eaton, S., Shevchenko, A. (2012) Efectos de la dieta y el desarrollo en el lipidoma de Drosophila. Mol Syst Biol, 8: 600. DOI: 10.1038 / msb.2012.29
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- Sampaio, JL, Gerl, MJ, Klose, C., Ejsing, CS, Beug, H., Simons, K., Shevchenko, A. (2011) Membrana lipidoma de una línea celular epitelial. PNAS, 108 (5), 1903-1907. DOI: 10.1073 / pnas.1019267108
- Ejsing, CS, Sampaio, JL, Surendranath, V., Duchoslav, E., Ekroos, K., Klemm, RW, Simons, K., Shevchenko, A. (2009) Análisis global del lipidoma de levadura mediante espectrometría de masas cuantitativa de escopeta . PNAS, 106 (7), 2136-2141. DOI: 10.1073 / pnas.0811700106