Caso de Éxito

Instituto Max Planck de Biología Celular Molecular y Genética, Alemania

 

P: ¿CUÁL ES EL ENFOQUE DE SU INVESTIGACIÓN DE LABORATORIO?

A: El laboratorio está dividido 50 / 50 entre investigación proteómica y lipidómica. Mientras trabajamos en el análisis de proteínas, como identificar redes de interacción de proteínas o caracterizar los proteomas de organismos que están relacionados muy distantemente con organismos con genomas secuenciados, también intentamos cuantificar mejor el lipidoma de varios orgánulos, células y tejidos.

P: ¿CUÁLES SON SUS OBJETIVOS PRINCIPALES?

A: En lipidómica, forjamos la alianza con la biología del desarrollo. El objetivo principal del grupo es combinar lipidómica con biología del desarrollo. A medida que los organismos crecen y se desarrollan a partir de una sola célula, los tejidos recientemente diferenciados requieren su propia composición única de lípidos de membrana. Esperamos caracterizar estos cambios a medida para comprender mejor cómo los defectos hereditarios en el metabolismo de los lípidos causan enfermedades. Estamos igualmente interesados ​​en los lipidomas de microdominios de membrana y la importancia biológica de su notable complejidad.

P: ¿POR QUÉ INCORPORARON EL TRIVERSA NANOMATE?® EN SU LABORATORIO?

A: Necesitábamos capacidades automatizadas de infusión directa de nanoflujo. La lipidómica de escopeta se basa en tasas de flujo bajas y estables, y el TriVersa NanoMate® tiene esta capacidad demostrada. Hemos comprado tres instrumentos adicionales porque nos permiten cambiar rápidamente entre lípidos y análisis proteómico.

P: ¿TIENES ALGUNA PUBLICACIÓN DE PRESENTACIONES UTILIZANDO TRIVERSA NANOMATE?®?
Destacado de la publicación
2021: La lipasa sensible a hormonas combina el metabolismo de los esteroles intergeneracionales para lograr el éxito reproductivo
Christoph Heier es autor correspondiente, Oskar Knittelfelder, Harald F Hofbauer, Wolfgang Mende, Ingrid Pörnbacher, Laura Schiller, Gabriele Schoiswohl, Hao Xie, Sebastian Grönke, Andrej Shevchenko, Ronald P Kühnlein
La lipasa sensible a hormonas (Hsl) se identificó como un regulador ancestral de la degradación de SE, que mejora la transferencia de esteroles intergeneracionales y el éxito reproductivo en las moscas.

Otras publicaciones

  • Knittelfelder, O., Prince, E., Sales, S., Fritzsche, E., Woehner, T., Brankatschk, M., Shevchenko, A. (2020) Esteroles como marcadores dietéticos para Drosophila melanogaster. BBA - Biología molecular y celular de lípidos, 1865 (7), 1388-1981. DOI: 10.1016 / j.bbalip.2020.158683
  • Trautenberg, LC, Knittelfelder, O., Hofmann, C., Shevchenko, A., Brankatschk, M., Prince, E. (2020) Cómo utilizar el desarrollo de larvas individuales de Drosophila como sensor metabólico. Revista de biología de insectos, 126, 0022-1910. DOI: 10.1016 / j.jinsphys.2020.104095
  • Wang, Y., Hinz, S., Uckermann, O., Hoenscheid, P., von Schoenfels, W., Burmesiter, G., Hendricks, A., Ackerman, JM, Baretton, GB, Hampe, J., Brosch , M., Schafmayer, C., Shevchenko, A., Seissig, S. (2020) Caracterización basada en la lipidómica de escopeta del panorama del metabolismo de los lípidos en el cáncer colorrectal. BBA - Biología molecular y celular de lípidos, 1865 (3), 1388-1981. DOI: 10.1016 / j.bbalip.2019.158579
  • Finkelstein, S. Gospe III, SM, Schuhmann, K., Shevkenko, A., Arshavsky, VM, Lobanova, ES (2020) Perfil de fosfoinositida de la retina del ratón. Celdas 9 (6), 1417. DOI: 10.3390 / cells9061417
  • Brankatschk, M., Gutmann, T., Knittelfelder, O., Palladini, A., Prince, E., Grzybek, M., Brankatschk, B., Shevchenko, A., Coskun, U., Eaton, S. ( 2018) Un cambio en la preferencia de alimentación dependiente de la temperatura mejora el desarrollo y la supervivencia de las drosphila en el frío. Célula de desarrollo, 46, 6, 781-793.e4. DOI: 10.1016 / j.devcel.2018.05.028
  • Fernández, C., Sandin, M., Sampaio, JL, Almgren, P., Narkiewicz, K., Hoffmann, M., Hedner, T., Wahlstrand, B., Simons, K., Shevchenko, A., James , P., Melander, O. (2013) Composición de lípidos plasmáticos y riesgo de desarrollar enfermedad cardiovascular. Más uno. DOI: 10.1371 / journal.pone.0071846
  • Ghosh, A., Kling, T., Snaidero, N., Sampaio, JL, Shevchenko, A., Gras, H., Geurten, B., Goepfert, MC, Schulz, JB, Voigt, A., Simons, M (2013) Una pantalla global de ARNi de drosophila in vivo identifica un papel clave de la ceramida fosfotolamina para la envoltura glial de los axones. PLOS Genetics. DOI: 10.1371 / journal.pgen.1003980
  • Schuhmann, K., Almeida, R., Baumert, M., Herzog, R., Bornstein, SR y Shevchenko, A. (2012) Lipidomics Shotgun en un espectrómetro de masas LTQ Orbitrap mediante cambios sucesivos entre modos de polaridad de adquisición. J. Mass. Spectrom., 47: 96-104. DOI: 10.1002 / jms.2031
  • Carvalho, M., Sampaio, JL, Palm, W., Brankatschk, M., Eaton, S., Shevchenko, A. (2012) Efectos de la dieta y el desarrollo en el lipidoma de Drosophila. Mol Syst Biol, 8: 600. DOI: 10.1038 / msb.2012.29
  • Luerschner, L.Richter, D., Hannibal-Bach, HK, Gaebler, A., Shevchenko, A., Ejsing, CS, Thiele, C. (2012) Los éter lípidos exógenos se dirigen predominantemente a las mitocondrias. MÁS UNO. DOI: 10.1371 / journal.pone.0031342
  • Sampaio, JL, Gerl, MJ, Klose, C., Ejsing, CS, Beug, H., Simons, K., Shevchenko, A. (2011) Membrana lipidoma de una línea celular epitelial. PNAS, 108 (5), 1903-1907. DOI: 10.1073 / pnas.1019267108
  • Ejsing, CS, Sampaio, JL, Surendranath, V., Duchoslav, E., Ekroos, K., Klemm, RW, Simons, K., Shevchenko, A. (2009) Análisis global del lipidoma de levadura mediante espectrometría de masas cuantitativa de escopeta . PNAS, 106 (7), 2136-2141. DOI: 10.1073 / pnas.0811700106

Dr. Andrej Shevchenko