Publicación

La estrategia de degradación de mucina de Ruminococcus gnavus: La importancia de la intramolecular trans-sialidasas

 

Instituto de Investigación Alimentaria, Centro de Análisis del Genoma, Universidad Aix-Marseille, Universidad de East Anglia

Resumen

Previamente identificamos y caracterizamos un intramolecular trans-sialidasa (IT-sialidasa) en el simbionte intestinal Ruminococcus gnavus ATCC 29149, que se asocia a la capacidad de la cepa de crecer sobre mucinas. En este trabajo hemos obtenido y analizado el borrador de la secuencia del genoma de otro R. gnavusdegradador de mucina, ATCC 35913, aislado de un individuo sano. Los análisis transcriptómicos de las cepas ATCC 29149 y ATCC 35913 confirmaron que la estrategia utilizada por R. gnavus para la degradación de mucina se centra en la utilización de glicanos de mucina terminales. R. gnavus ATCC 35913 también codifica una IT-sialidasa predicha y alberga un grupo Nan dedicado a la utilización de ácido siálico. Demostramos que el grupo Nan se regulaba positivamente cuando las cepas se cultivaban en presencia de mucina. Además demostramos que tanto R. gnavus las cepas pudieron crecer en 2,7-anyhidro-Neu5Ac, el producto de transglicosilación de IT-sialidasa, como única fuente de carbono. Tomados en conjunto, estos datos apoyan aún más la hipótesis de que los microbios intestinales que expresan la IT-sialidasa, proporcionan bacterias comensales como R. gnavus con una ventaja competitiva nutricional, al acceder y transformar una fuente de nutrientes en beneficio propio.

El análisis de espectrometría de masas se realizó en el Advion exprensaion Espectrómetro de masas compacto (CMS) y los datos se evaluaron utilizando el software Advion Data Express.