Success Story

Institut Max Planck de biologie cellulaire et génétique, Allemagne

 

Q : QUEL EST L'OBJECTIF DE LA RECHERCHE DE VOTRE LABORATOIRE ?

A: Le laboratoire est divisé 50 / 50 entre les recherches en protéomique et en lipidomique. Tout en travaillant sur l’analyse des protéines, comme l’identification de réseaux d’interaction entre protéines ou la caractérisation des protéomes d’organismes très éloignés d’organismes à génomes séquencés, nous essayons également de mieux quantifier le lipidome de divers organites, cellules et tissus.

Q : QUELS SONT VOS OBJECTIFS PRINCIPAUX ?

A: En lipidomique, nous formons une alliance avec la biologie du développement. L'objectif principal du groupe est de combiner la lipidomique à la biologie du développement. À mesure que les organismes se développent et se développent à partir d'une seule cellule, les tissus nouvellement différenciés nécessitent leur propre composition lipidique membranaire. Nous espérons caractériser ces changements sur mesure afin de mieux comprendre comment les déficiences héréditaires du métabolisme des lipides causent des maladies. Nous nous intéressons également aux lipidomes des microdomaines membranaires et à l’importance biologique de sa complexité remarquable.

Q : POURQUOI AVEZ-VOUS INTÉGRÉ LE NANOMATE TRIVERSA® DANS VOTRE LABORATOIRE ?

A: Nous avions besoin de capacités automatisées d'infusion directe à nanoflux. La lipidomique des fusils de chasse repose sur des débits faibles et stables, et le TriVersa NanoMate® a cette capacité démontrée. Nous avons acheté trois instruments supplémentaires car ils nous permettent de passer rapidement de l'analyse des lipides à l'analyse protéomique.

Q : AVEZ-VOUS DES PUBLICATIONS DE PRÉSENTATIONS UTILISANT LE NANOMATE TRIVERSA®?
Point culminant de la publication
2021: La lipase hormonosensible associe le métabolisme intergénérationnel des stérols au succès de la reproduction
Christoph Heier est un auteur correspondant, Oskar Knittelfelder, Harald F Hofbauer, Wolfgang Mende, Ingrid Pörnbacher, Laura Schiller, Gabriele Schoiswohl, Hao Xie, Sebastian Grönke, Andrej Shevchenko, Ronald P Kühnlein
La lipase hormonosensible (Hsl) a été identifiée comme un régulateur ancestral de la dégradation du SE, ce qui améliore le transfert intergénérationnel des stérols et le succès reproducteur chez les mouches.

Autres publications:

  • Knittelfelder, O., Prince, E., Sales, S., Fritzsche, E., Woehner, T., Brankatschk, M., Shevchenko, A. (2020) Stérols comme marqueurs diététiques de Drosophila melanogaster. BBA - Biologie moléculaire et cellulaire des lipides, 1865 (7), 1388-1981. DOI: 10.1016 / j.bbalip.2020.158683
  • Trautenberg, LC, Knittelfelder, O., Hofmann, C., Shevchenko, A., Brankatschk, M., Prince, E. (2020) Comment utiliser le développement de larves individuelles de drosophile comme capteur métabolique. Journal of Insect Biology, 126, 0022-1910. DOI: 10.1016 / j.jinsphys.2020.104095
  • Wang, Y., Hinz, S., Uckermann, O., Hoenscheid, P., von Schoenfels, W., Burmesiter, G., Hendricks, A., Ackerman, JM, Baretton, GB, Hampe, J., Brosch , M., Schafmayer, C., Shevchenko, A., Seissig, S. (2020) Caractérisation basée sur la lipidomique Shotgun du paysage du métabolisme des lipides dans le cancer colorectal. BBA - Biologie moléculaire et cellulaire des lipides, 1865 (3), 1388-1981. DOI: 10.1016 / j.bbalip.2019.158579
  • Finkelstein, S.Gospe III, SM, Schuhmann, K., Shevkenko, A., Arshavsky, VM, Lobanova, ES (2020) Profil de phophoinositide de la rétine de souris. Cellules 9 (6), 1417. DOI: 10.3390 / cellules 9061417
  • Brankatschk, M., Gutmann, T., Knittelfelder, O., Palladini, A., Prince, E., Grzybek, M., Brankatschk, B., Shevchenko, A., Coskun, U., Eaton, S. ( 2018) Un changement de préférence alimentaire en fonction de la température améliore le développement de la drosphila et sa survie dans le froid. Developmental Cell, 46, 6, 781-793.e4. DOI: 10.1016 / j.devcel.2018.05.028
  • Fernandez, C., Sandin, M., Sampaio, JL, Almgren, P., Narkiewicz, K., Hoffmann, M., Hedner, T., Wahlstrand, B., Simons, K., Shevchenko, A., James , P., Melander, O. (2013) Composition lipidique plasmatique et risque de développer une maladie cardiovasculaire. PLOS One. DOI: 10.1371 / journal.pone.0071846
  • Ghosh, A., Kling, T., Snaidero, N., Sampaio, JL, Shevchenko, A., Gras, H., Geurten, B., Goepfert, MC, Schulz, JB, Voigt, A., Simons, M (2013) Un criblage global in vivo de l'ARN de la drosophile identifie un rôle clé de la céramide phosphothanolamine pour l'ensilage glial des axones. PLOS Genetics. DOI: 10.1371 / journal.pgen.1003980
  • Schuhmann, K., Almeida, R., Baumert, M., Herzog, R., Bornstein, SR et Shevchenko, A. (2012) Shotgun lipidomics sur un spectromètre de masse LTQ Orbitrap par commutation successive entre les modes de polarité d'acquisition. J. Mass. Spectrom., 47: 96-104. DOI: 10.1002 / jms.2031
  • Carvalho, M., Sampaio, JL, Palm, W., Brankatschk, M., Eaton, S., Shevchenko, A. (2012) Effets de l'alimentation et du développement sur le lipidome de la drosophile. Mol Syst Biol, 8: 600. DOI: 10.1038 / msb.2012.29
  • Luerschner, L. Richter, D., Hannibal-Bach, HK, Gaebler, A., Shevchenko, A., Ejsing, CS, Thiele, C. (2012) Les lipides éthérés exogènes ciblent principalement les mitochondries. PLOS ONE. DOI: 10.1371 / journal.pone.0031342
  • Sampaio, JL, Gerl, MJ, Klose, C., Ejsing, CS, Beug, H., Simons, K., Shevchenko, A. (2011) Lipidome membranaire d'une lignée cellulaire épithéliale. PNAS, 108 (5), 1903-1907. DOI: 10.1073 / pnas.1019267108
  • Ejsing, CS, Sampaio, JL, Surendranath, V., Duchoslav, E., Ekroos, K., Klemm, RW, Simons, K., Shevchenko, A. (2009) Analyse globale du lipidome de levure par spectrométrie de masse quantitative par fusil de chasse . PNAS, 106 (7), 2136-2141. DOI: 10.1073 / pnas.0811700106

Dr. Andrej Shevchenko