Success Story

Université de Birmingham, groupe de spectrométrie de masse Cooper

 

Quel est l'objet de la recherche de votre laboratoire?

Notre recherche se concentre sur sur place analyse de protéines intactes à partir de substrats biologiques. Nous combinons les techniques de surface ambiante et la spectrométrie de mobilité ionique avec la spectrométrie de masse haute résolution.

Nous nous intéressons particulièrement à la spectrométrie de masse ambiante native, dans laquelle des protéines repliées, des assemblages de protéines et des complexes de protéines sont prélevés directement à partir de coupes de tissus minces. La spectrométrie de masse ambiante native, telle que l'analyse de surface d'extraction de liquide (LESA), est intégrée à l'imagerie par spectrométrie de masse pour fournir des informations spatiales et structurelles simultanées.

Nous appliquons également LESA pour l'analyse de protéines intactes mais dépliées à partir d'une gamme de substrats, y compris des colonies microbiennes vivantes poussant sur de la gélose et d'autres substrats solides, des taches de sang séchées et des coupes de tissus. La combinaison du LESA, de la spectrométrie de mobilité ionique et de la spectrométrie de masse permet la détection de centaines de protéines.

Pourquoi avez-vous intégré le TriVersa NanoMate® dans votre laboratoire

Au départ, nous avons acheté le TriVersa NanoMate® pour l'infusion directe et le couplage à LC et nous utilisons toujours l'équipement à cette fin. La technologie de puce d'Advion a révolutionné le nanospray en termes de facilité d'utilisation. L'ESI Chip™ est robuste et contourne tout problème de non-uniformité. Cela nous permet de passer simplement à la buse suivante en cas de problème de pulvérisation. La capacité de détection de pulvérisation est très intelligente et nécessaire pour nos courses de nuit. Plus récemment, nous avons utilisé la capacité LESA du TriVersa NanoMate® pour nos analyses in situ des protéines dans les tissus, les taches de sang séché et les colonies microbiennes.

À qui recommanderiez-vous le TriVersa NanoMate® pour leurs recherches ?

Je recommanderais le TriVersa NanoMate® à toute personne possédant un spectromètre de masse qui utilise le nanoélectrospray.

Avez-vous des publications ou des présentations utilisant le TriVersa NanoMate®?

Point culminant de la publication

Analyse de surface par extraction liquide Spectrométrie de masse des pathogènes ESKAPE

Havlikova et coll. J Am Soc Mass Spec. 2021

Le LESA MS / MS de haut en bas a été utilisé pour l'identification des protéines chez quatre pathogènes ESKAPE ainsi que E. faecalis V583 et un isolat clinique de A. baumannii.

Autres publications:
  • Hale et coll. Imagerie par spectrométrie de masse native et identification top-down in situ des protéines intactes directement à partir du tissu. J Am Soc Mass Spec. EST CE QUE JE: 10.1021 / jasms.0c00226
  • Havlikova et coll. Identification directe de protéines bactériennes et humaines à partir de plaies infectées dans des modèles de peau 3D vivants. DOI du représentant scientifique : 10.1038/s41598-020-68233-6
  • Haque et coll. L'auto-incompatibilité déclenche une modification oxydative irréversible des protéines dans le pollen incompatible. Physiologie végétale. DOI: 10.1104 / pp.20.00066
  • Sisley et coll. Spectrométrie de masse à mobilité ionique cyclique LESA de protéines intactes à partir de coupes de tissus minces. Anal. Chem. EST CE QUE JE: 10.1021 / acs.analchem.9b05169
  • Hale et coll. LESA TWIMS-MSI natifs: analyse spatiale, conformationnelle et de masse de protéines et de complexes protéiques. J Am Soc Mass Spec. EST CE QUE JE: 10.1021 / jasms.9b00122
  • Kocurek et coll. Electroporation et spectrométrie de masse: Un nouveau paradigme pour l'analyse in situ de protéines intactes provenant de colonies de levures vivantes. Chimie analytique / DOI: 10.1021 / acs.analchem.9b04365
  • Griffiths et coll. Imagerie complète par spectrométrie de masse LESA de protéines intactes par intégration de FAIMS cylindriques. Chimie analytique. EST CE QUE JE: 10.1021 / acs.analchem.9b05124
  • Havlikova et coll. Imagerie quantitative des protéines dans les tissus par spectrométrie de masse. Chimie analytique. EST CE QUE JE: 10.1021 / acs.analchem.9b04148
  • Griffiths et coll. Imagerie LESA MS de tissus congelés et conservés à la chaleur: avantage du FAIMS statique à plusieurs étapes. Chimie analytique. EST CE QUE JE: 10.1021 / acs.analchem.8b02739
  • Rosting et coll. Spectrométrie de mobilité ionique à forme d'onde asymétrique à champ élevé dans la protéomique ascendante non ciblée des taches de sang séché. J Proteom Res. EST CE QUE JE: 10.1021 / acs.jproteome.7b00746
  • Sarsby et coll. Analyse de surface par extraction liquide spectrométrie de masse couplée à une spectrométrie de mobilité ionique de forme d'onde asymétrique de champ pour l'analyse de protéines intactes à partir de substrats biologiques Chimie analytique. DOI: 10.1021 / acs.analchem.5b01151
  • Griffiths et coll. Analyse de surface d'extraction de liquide spectrométrie de masse de spectrométrie de mobilité ionique de forme d'onde asymétrique pour l'analyse des taches de sang séché. Analyste. EST CE QUE JE: 10.1039 / C5AN00933B
  • Sarsby et coll. Identification descendante et ascendante des protéines par analyse de surface par extraction liquide spectrométrie de masse de tissus hépatiques humains sains et malades. J Am Soc Mass Spec. EST CE QUE JE:10.1007 / s13361-014-0967-z
  • Randall et coll. Analyse directe des protéines intactes des colonies d'Escherichia coli par analyse de surface par extraction liquide spectrométrie de masse. Chimie analytique. EST CE QUE JE: 10.1021 / ac503349d
  • Edwards et coll. Hétérozygotes composés et bêta-thalassémie: spectrométrie de masse descendante pour la détection des hémoglobinopathies. PROTEOMIQUE. EST CE QUE JE: 10.1002 / pmic.201300316
  • Martin et coll. Protéomique des taches de sang séché: Extraction de surface de protéines endogènes couplée à la préparation automatisée des échantillons et à la spectrométrie de masse. J Am Soc Mass Spec. EST CE QUE JE: 10.1007/s13361-013-0658-1
  • Edwards et coll. Analyse des variantes d'hémoglobine via un prélèvement de surface direct de taches de sang séché couplé à une spectrométrie de masse à haute résolution. Chimie analytique. DOI: 10.1021 / ac1030804

Dr. Helen Cooper