Quantification précise des espèces lipidiques affectées par le chevauchement isobare dans la spectrométrie de masse à transformée de Fourier
Auteurs : Hôpital universitaire de Ratisbonne, Laboratoire européen de biologie moléculaire, Allemagne ; Université du Danemark du Sud, Danemark
Abstract
Les données lipidomiques nécessitent la prise en compte d'ions avec des masses presque identiques, ce qui comprend entre autres le chevauchement isotopique de type II. Ce chevauchement se produit dans des séries d'espèces lipidiques ne différant que par le nombre de doubles liaisons (DB) principalement en raison de l'abondance naturelle de 13C-atomes. La spectrométrie de masse à haute résolution, telle que la spectrométrie de masse à transformée de Fourier (FTMS), est capable de résoudre le chevauchement de type II en fonction du pouvoir de résolution de masse. Dans ce travail, nous avons évalué la précision de la quantification FTMS des espèces lipidiques affectées par le chevauchement de type II. Des expériences de pointe avec des paires d'espèces lipidiques de diverses classes de lipides ont été analysées par analyse par injection de flux-FTMS. La précision de la quantification a été évaluée sans et avec correction de type II (en utilisant l'abondance relative des isotopes) ainsi qu'en utilisant le premier pic isotopique (M+1). Les pics isobares, qui étaient suffisamment résolus, étaient les plus précis sans correction de type II. Dans les cas de pics partiellement résolus, nous avons observé des pics d'interférence provoquant des distorsions de masse et d'intensité, ce qui est un phénomène bien décrit en FTMS. Les concentrations des espèces respectives étaient plus précises lorsqu'elles étaient calculées à partir de M+1. De plus, certaines espèces mineures, affectées par un chevauchement important de type II, n'ont pu être quantifiées que par M+1. De manière inattendue, même des pics complètement non résolus étaient considérablement surcorrigés par la correction de type II en raison des interférences de pic. La méthode décrite a été validée, y compris les précisions intraday et interday pour les échantillons de sérum humain et de fibroblastes. Pris ensemble, nos résultats montrent que la quantification précise des espèces lipidiques par FTMS nécessite une analyse des données dépendante de la résolution.
Les échantillons ont été perfusés à l'aide du Advion Interchim Scientific® TriVersa NanoMate®.