Profilage lipidique de 20 cellules de mammifères par microéchantillonnage capillaire combiné à une spectrométrie de masse à perfusion directe par nanoélectrospray à ionisation par couture spectrale haute résolution
Abstract
Les études du métabolisme cellulaire peuvent apporter des connaissances approfondies sur les mécanismes moléculaires sous-jacents et la fonction métabolique. À ce jour, la majorité des études du métabolisme cellulaire basées sur la chromatographie couplée à la spectrométrie de masse (MS) nécessitent l'analyse de populations cellulaires pour obtenir un métabolome informatif. Ces méthodes sont non seulement chronophages, mais également inadaptées aux échantillons cellulaires en quantité limitée, tels que les cellules tumorales circulantes, les cellules souches et les neurones. Il est donc essentiel de développer des méthodes analytiques permettant de détecter le métabolome de dizaines de cellules à haut débit et avec une sensibilité élevée. Dans ce travail, une nouvelle plateforme de détection rapide et sensible du lipidome dans 20 cellules de mammifères a été proposée, utilisant le microéchantillonnage capillaire associé à la spectrométrie de masse à perfusion directe par nanoélectrospray à ionisation par assemblage spectral haute résolution. Elle permet de collecter rapidement et précisément des cellules via une microsonde capillaire, d'extraire les lipides directement dans une plaque 96 puits à l'aide d'un solvant de pulvérisation et de détecter plus de 500 lipides couvrant 19 sous-classes lipidiques en 3 minutes. Cette nouvelle plateforme a été utilisée avec succès pour étudier les caractéristiques lipidiques de différents types et sous-types de cellules cancéreuses, ainsi que de cellules cibles issues d'échantillons tissulaires. Cette étude propose une stratégie pour déterminer les espèces lipidiques grâce à des informations riches sur des dizaines de cellules et démontre un fort potentiel d'applications cliniques.
Advion Interchim Scientifique® Triversa NanoMate® (Advion, Ithaca, NY) a été utilisé.