Stratégie d'annotation et de quantification métabolomique non ciblée à l'aide d'une spectrométrie de masse à perfusion directe par nanoélectrospray à assemblage spectral haute résolution avec acquisition indépendante des données
Abstract
La spectrométrie de masse haute résolution par ionisation par nanoélectrospray à perfusion directe (DI-nESI-HRMS) est une approche alternative aux techniques de chromatographie-MS pour la métabolomique non ciblée, offrant un échantillon de haute qualité tout au long de la chaîne. Cependant, la précision de l'annotation des analytes reste problématique. Dans cette étude, nous avons proposé une stratégie d'annotation et de quantification des données métabolomiques non ciblées à l'aide d'une méthode DI-nESI-HRMS à assemblage spectral avec acquisition indépendante des données. La stratégie d'annotation des métabolites comprenait la distribution isotopique, la similarité des spectres MS/MS, la corrélation des ions précurseurs et produits, ainsi que la correspondance des caractéristiques des métabolites extraits avec les précurseurs des métabolites ciblés. Deux groupes de solutions étalons mixtes contenant respectivement 40 et 79 métabolites ont été utilisés pour établir la stratégie d'annotation des métabolites et valider sa fiabilité. Les résultats ont montré que les étalons détectés pouvaient être bien annotés selon les trois principales explications et que les pourcentages qualitatifs totaux étaient de 100 % (40 sur 40) pour la solution étalon et de 94.9 % (74 sur 78) pour les étalons ajoutés à la matrice sérique. L'intensité des ions précurseurs a été utilisée pour la quantification, à l'exception des isomères, qui ont été quantifiés par l'intensité des ions produits caractéristiques, le cas échéant. Enfin, la stratégie a été appliquée à l'étude de la métabolomique sérique dans le diabète, et les résultats ont démontré qu'elle est prometteuse pour une étude métabolomique de cohorte à grande échelle.
Advion Interchim Scientifique® Triversa NanoMate® (Advion, Ithaca, NY) a été utilisé.