La stratégie de dégradation de la mucine de Ruminococcus gnavus: L'importance de l'intramoléculaire trans-sialidases
Institut de recherche alimentaire, Centre d'analyse du génome, Université Aix-Marseille, Université d'East Anglia
Abstract
Nous avons précédemment identifié et caractérisé un intramoléculaire trans-sialidase (IT-sialidase) dans le symbiote intestinal Ruminococcus gnavus ATCC 29149, qui est associée à la capacité de la souche à se développer sur les mucines. Dans ce travail, nous avons obtenu et analysé le projet de séquence génomique d'un autre R. gnavusdégrader de mucine, ATCC 35913, isolé d'un individu sain. Les analyses transcriptomiques des souches ATCC 29149 et ATCC 35913 ont confirmé que la stratégie utilisée par R. gnavus pour la dégradation de la mucine se concentre sur l'utilisation des mucines glycanes terminaux. R. gnavus ATCC 35913 code également une IT-sialidase prédite et héberge un cluster Nan dédié à l'utilisation de l'acide sialique. Nous avons montré que le cluster Nan était régulé à la hausse lorsque les souches étaient cultivées en présence de mucine. De plus, nous avons démontré que les deux R. gnavus les souches ont pu se développer sur 2,7-anyhydro-Neu5Ac, le produit de transglycosylation de l'IT-sialidase, comme seule source de carbone. Pris ensemble, ces données appuient l'hypothèse selon laquelle les microbes intestinaux exprimant l'IT-sialidase, fournissent des R. gnavus avec un avantage nutritionnel compétitif, en accédant et en transformant une source de nutriments à leur propre avantage.
L'analyse par spectrométrie de masse a été réalisée sur l'Advion Interchim Scientific® exPression® Spectromètre de masse compact (CMS) et les données ont été évaluées à l'aide d'Advion Interchim Scientific® Logiciel Data Express.