サクセスストーリー

マックスプランク分子細胞生物学および遺伝学研究所、ドイツ

 

Q:あなたのラボ研究の焦点は何ですか?

A: 実験室はプロテオミクスとリピドミクスの研究の間で50 / 50に分かれています。 タンパク質相互作用ネットワークの特定や、配列決定されたゲノムを持つ生物と非常に遠い関係にある生物のプロテオームの特性評価などのタンパク質分析に取り組んでいる一方で、さまざまなオルガネラ、細胞、組織のリピドームの定量化も試みています。

Q:あなたの主な目標は何ですか?

A: リピドミクスでは、発生生物学との提携を築きます。 このグループの主な目標は、リピドミクスと発生生物学を組み合わせることです。 生物が単一の細胞から成長および発達するにつれて、新しく分化した組織には独自の膜脂質組成が必要になります。 脂質代謝の継承された欠陥がどのように病気を引き起こすかをよりよく理解するために、これらの調整された変化を特徴付けたいと思います。 膜ミクロドメインのリピドームおよびその驚くべき複雑さの生物学的意義にも同様に興味があります。

Q:TRIVERSANANOMATEを組み込んだ理由® あなたの研究室に?

A: 自動化されたナノフロー直接注入機能が必要でした。 ショットガンリピドミクスは、低速で安定した流量とTriVersaNanoMateに依存しています® この実証された能力を持っています。 脂質とプロテオミクス分析をすばやく切り替えることができるため、XNUMXつの追加の機器を購入しました。

Q:TRIVERSANANOMATEを使用したプレゼンテーションの出版物はありますか?®?
出版物のハイライト
2021年:ホルモン感受性リパーゼが世代間ステロール代謝と生殖成功を結びつける
Christoph Heierは対応する著者であり、Oskar Knittelfelder、Harald F Hofbauer、Wolfgang Mende、IngridPörnbacher、Laura Schiller、Gabriele Schoiswohl、Hao Xie、SebastianGrönke、Andrej Shevchenko、RonaldPKühnlein
ホルモン感受性リパーゼ(Hsl)は、世代間のステロール移動とハエの繁殖成功を改善するSE分解の祖先の調節因子として同定されました。

その他の出版物:

  • Knittelfelder、O.、Prince、E.、Sales、S.、Fritzsche、E.、Woehner、T.、Brankatschk、M.、Shevchenko、A。(2020)キイロショウジョウバエの食餌マーカーとしてのステロール。 BBA –脂質の分子および細胞生物学、1865(7)、1388-1981。 DOI:10.1016 / j.bbalip.2020.158683
  • Trautenberg、LC、Knittelfelder、O.、Hofmann、C.、Shevchenko、A.、Brankatschk、M.、Prince、E。(2020)個々のショウジョウバエ幼虫の発育を代謝センサーとして使用する方法。 Journal of Insect Biology、126、0022-1910。 DOI:10.1016 / j.jinsphys.2020.104095
  • Wang、Y.、Hinz、S.、Uckermann、O.、Hoenscheid、P.、von Schoenfels、W.、Burmesiter、G.、Hendricks、A.、Ackerman、JM、Baretton、GB、Hampe、J.、Brosch 、M.、Schafmayer、C.、Shevchenko、A.、Seissig、S。(2020)結腸直腸癌における脂質代謝の風景のショットガンリピドミクスベースの特性評価。 BBA –脂質の分子および細胞生物学、1865(3)、1388-1981。 DOI:10.1016 / j.bbalip.2019.158579
  • Finkelstein、S。Gospe III、SM、Schuhmann、K.、Shevkenko、A.、Arshavsky、VM、Lobanova、ES(2020)マウス網膜のホスホイノシチドプロファイル。 セル9(6)、1417。DOI:10.3390 / cells9061417
  • Brankatschk、M.、Gutmann、T.、Knittelfelder、O.、Palladini、A.、Prince、E.、Grzybek、M.、Brankatschk、B.、Shevchenko、A.、Coskun、U.、Eaton、S。( 2018)摂食嗜好の温度依存スイッチは、ショウジョウバエの発生と寒さでの生存を改善します。 発生細胞、46、6、781-793.e4。 DOI:10.1016 / j.devcel.2018.05.028
  • Fernandez、C.、Sandin、M.、Sampaio、JL、Almgren、P.、Narkiewicz、K.、Hoffmann、M.、Hedner、T.、Wahlstrand、B.、Simons、K.、Shevchenko、A.、James 、P。、メランダー、O。(2013)血漿脂質組成と心血管疾患を発症するリスク。 PLOSOne。 DOI:10.1371 / journal.pone.0071846
  • Ghosh、A.、Kling、T.、Snaidero、N.、Sampaio、JL、Shevchenko、A.、Gras、H.、Geurten、B.、Goepfert、MC、Schulz、JB、Voigt、A.、Simons、M 。(2013)グローバルなin vivoショウジョウバエRNAiスクリーンは、軸索のグリア細胞被覆に対するセラミドホスホタノールアミンの重要な役割を特定します。 PLOS遺伝学。 DOI:10.1371 / journal.pgen.1003980
  • Schuhmann、K.、Almeida、R.、Baumert、M.、Herzog、R.、Bornstein、SR and Shevchenko、A。(2012)取得極性モードを連続的に切り替えることによるLTQOrbitrap質量分析計でのショットガンリピドミクス。 J.Mass。Spectrom。、47:96-104。 DOI:10.1002 / jms.2031
  • Carvalho、M.、Sampaio、JL、Palm、W.、Brankatschk、M.、Eaton、S.、Shevchenko、A。(2012)ショウジョウバエのリピドームに対する食事と発達の影響。 Mol Syst Biol、8:600。 DOI:10.1038 / msb.2012.29
  • Luerschner、L。Richter、D.、Hannibal-Bach、HK、Gaebler、A.、Shevchenko、A.、Ejsing、CS、Thiele、C。(2012)外因性エーテル脂質は主にミトコンドリアを標的とします。 PLOSONE。 DOI:10.1371 / journal.pone.0031342
  • Sampaio、JL、Gerl、MJ、Klose、C.、Ejsing、CS、Beug、H.、Simons、K.、Shevchenko、A。(2011)上皮細胞株の膜リピドーム。 PNAS、108(5)、1903-1907。 DOI:10.1073 / pnas.1019267108
  • Ejsing、CS、Sampaio、JL、Surendranath、V.、Duchoslav、E.、Ekroos、K.、Klemm、RW、Simons、K.、Shevchenko、A。(2009)定量的ショットガン質量分析による酵母リピドームのグローバル分析。 PNAS、106(7)、2136-2141。 DOI:10.1073 / pnas.0811700106

アンドレイ・シェフチェンコ博士