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異なる作用モードを持つ新規US28小分子リガンドの構造ベースの発見

 

マイケル・リュックマン、ロクサナ・マリア・アマランディ、ナタリア・パパルギリ、メッテ・H・ヤコブセン、エリザベス・クリスチャンセン、ラース・J・ジェンセン、オーレル・プイ、スエ・W・シュワルツ、メッテ・M・ローゼンキルデ、トーマス・M・フリミュラー

ヒトサイトメガロウイルスにコードされたGタンパク質共役型受容体US28は、さまざまなケモカインを認識できる構成的に活性な受容体です。 2.9Åの結晶構造が最近決定されたにもかかわらず、強力でUS28固有のツールコンパウンドはまだ不足しています。 ここでは、洗練されたUS28:VUF2274複合体からの構造情報を使用して、12万を超える市販の小分子化合物の仮想スクリーニングを行いました。 受容体ベースとリガンドベースのアプローチを組み合わせて、上位98%ランクの化合物のうち0.1をテストし、ChEMBLデータベースの約1.45万の既知のリガンドと比較して新しいケモタイプを明らかにしました。 IP蓄積とCaの両方で、XNUMXつの化合物がそれぞれアゴニストとインバースアゴニストとして確認されました。2+動員アッセイ。 この研究で提示されたスクリーニング設定は、計算的に安価であり、したがって、実際の化学合成なしで結合および異なる機能アッセイおよび/または種の同時試験を可能にするため、アカデミック環境で特に有用です。

LC / MS分析は、AdvionExpression®CMSを使用して実行されました。