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のムチン分解戦略 ルミノコッカスgnavus:分子内の重要性 トランス-シアリダーゼ

 

イーストアングリア大学エクスマルセイユ大学ゲノム解析センター食品研究所

抽象

私たちは以前に分子内を同定し、特徴づけました トランス-腸内共生生物のシアリダーゼ(IT-シアリダーゼ) ルミノコッカスgnavus ATCC 29149は、ムチン上で増殖する菌株の能力に関連しています。 この作業では、別のドラフトゲノム配列を取得して分析しました R.グナバス健康な個人から分離されたムチン分解物、ATCC35913。 ATCC29149株とATCC35913株の両方のトランスクリプトミクス分析により、 R.グナバス ムチン分解のために、末端ムチングリカンの利用に焦点が当てられています。 R.グナバス ATCC 35913は、予測されるITシアリダーゼもエンコードし、シアル酸の利用に特化したNanクラスターを備えています。 ムチンの存在下で菌株を増殖させると、Nanクラスターがアップレギュレートされることを示した。 さらに、両方が R.グナバス 菌株は、IT-シアリダーゼ糖転移産物である2,7-anyhydro-Neu5Acを唯一の炭素源として増殖することができました。 これらのデータを総合すると、ITシアリダーゼを発現する腸内微生物が次のような共生細菌を提供するという仮説がさらに支持されます。 R.グナバス 栄養源にアクセスして自分たちの利益に変えることにより、栄養上の競争上の優位性を持ちます。

質量分析はAdvionexで実行されましたpressionイオン コンパクト質量分析計(CMS)とデータは、Advion DataExpressソフトウェアを使用して評価されました。