西班牙生物医学研究所(IRB Barcelona)
您实验室的研究重点是什么?
我们的目标是为巴塞罗那IRB及其合作者的研究社区提供最先进的工具和方法,用于对从大蛋白质和DNA到小分子的各种生物物种进行质谱分析。 最终目的是深入了解这些分子的身份,结构,与其他分子的相互作用以及生物学功能,以帮助进行药物设计,阐明蛋白质机制以及寻找生物标志物。 我们已经实施了自上而下的蛋白质组学方法,并且是西班牙MS战略的先驱。
作为核心设施,我们负责处理不同的生物分子,我们需要不断有效地改变方法。
TriVersa NanoMate 如何® 与您的研究目标一致?
最初,我们购买了 TriVersa NanoMate® 用于非共价相互作用分析的基于芯片的直接注入模式,但我们很快了解到它可以应用于我们研究的其他领域。 在使用 TriVersa NanoMate 之前®,收集分数所涉及的步骤既痛苦又耗时。 使用 TriVersa NanoMate®,我们可以运行 LC/馏分收集或输液,而无需更改设置并浪费时间进行稳定化。 我们没有遇到传统纳米电喷雾源的典型问题。
TriVersa NanoMate 的一方面® 给我们留下深刻印象的是能够通过 LC 兼容性分析复杂的自上而下样品。 不可能在 LC 时间尺度上分析这些样品,而馏分收集能力使我们能够以以前不可能的方式进行分析。
您会向谁推荐 TriVersa NanoMate® 为他们的研究?
我们使用 TriVersa NanoMate® 一切; 非共价相互作用、自上而下、中下、自下而上、基本注入、LC 耦合到馏分收集。 该仪器在其所有不同的设置中都很有用,尤其是无需更换源并等待稳定的喷雾。
系统的可靠性是最大的好处之一,特别是对于必须在应用程序之间频繁更改的人。 我们发现喷雾传感功能非常有价值,因为我们知道我们珍贵的样品不会丢失。
您是否有任何使用 TriVersa NanoMate 的出版物或演示文稿®?
出版要点
通过自上而下和自下而上的质谱方法相结合的人类精子鱼精蛋白蛋白形式的表征。
Soler-Ventura等。 蛋白质组研究杂志,2020,19(1),221-237。 DOI: 10.1021 / acs.jproteome.9b00499
使用自上而下的MS方法和基于蛋白酶K消化的自下而上的MS方法鉴定了正常精子个体中精子鱼精蛋白的蛋白形式,包括其翻译后修饰。
其他刊物
- Arauz-Garofalo等。 通过自上而下的蛋白质组学对鱼精蛋白进行表征:利用DBSCAN增强蛋白形式的鉴定。 蛋白质组,2021年。DOI: 10.3390 / proteomes9020021
- Yero等。 这 绿脓杆菌 底物结合蛋白Ttg2D作为跨周质的一般甘油磷脂转运蛋白。 Comm Bio,2021年。DOI: 10.1038/s42003-021-01968-8
- Molnar等。 组蛋白密码阅读器PHD手指蛋白7控制果蝇中基因表达和恶性肿瘤的性别相关差异。 Sci Adv,2019年。DOI: 10.1126 / sciadv.aaw7965
- 纳达尔等。 同二聚体雄激素受体配体结合结构域的结构。 Nat Commun,2017年。DOI: 10.1038 / ncomms14388
- Testoni等。 缺乏糖原蛋白会导致糖原积累和肌肉功能受损。 细胞代谢,2017年。DOI: 10.1016 / j.cmet.2017.06.008
- Izquierdo-Serra等。 使用靶向共价光电开关对内源性受体和细胞兴奋性的光学控制。 Nat Commun,2016年。DOI: 10.1038 / ncomms12221
- Pujol-Pina等。 对Aβ低聚物的SDS-PAGE分析仍缺乏对阿尔茨海默氏病的研究:呼吁采用ESI-IM-MS。 科学代表,2015年。DOI: 10.1038 / srep14809
- Saez等。 PPh的影响3 分子在新型有机金属钌配合物的抗癌活性中的作用J Inorg Biochem,2014年。DOI: 金有机生物杂志.2014.03.002
- 博格等。 血浆设计的免疫亲和柱消耗后脑脊液中蛋白质动态范围的光谱计数评估。 临床蛋白质组学,2011年。DOI: 10.1186/1559-0275-8-6