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人类心脏组蛋白的蛋白质异构体解析图谱
抽象
组蛋白变体组成以及核心组蛋白和连接组蛋白的翻译后修饰（PTM）共同调控染色质结构和组织特异性基因表达。然而，全面解析天然人体组织中“组蛋白密码”的复杂性仍然极具挑战性。本文构建了人类心脏组蛋白蛋白质组图谱，该图谱包含完整的组蛋白变体及其组合式PTM，并基于简化的自上而下蛋白质组学工作流程。在一次一维反相液相色谱（LC）-质谱（MS）联用分析中，我们直接从人心肌组织中实现了所有四个核心组蛋白家族（H2A、H2B、H3和H4）以及连接组蛋白H1的基线分离。值得注意的是，这种完整蛋白质分析保留了共存PTM与单个组蛋白分子之间的关联性，从而揭示了组合式组蛋白密码，实现了在色谱尺度上对组蛋白变体组成和PTM化学计量比进行蛋白质组水平的定量分析。靶向串联质谱(MS/MS)可直接解析共存的PTM组合，并区分高度同源的组蛋白亚型。利用该方法，我们构建了首个全面的心脏组蛋白蛋白质组异构体图谱，并发现了此前未曾观察到的组蛋白蛋白质组异构体。更广泛地说，这种自上而下的蛋白质组学工作流程为复杂生物系统中组蛋白变体和PTM的蛋白质组异构体解析分析提供了一个稳健的框架。
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