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霍霍巴(Simmondsia chinensis)的基因组:分类学上指导其种子中蜡酯积累的物种

 

北德克萨斯大学,华中农业大学,海因里希·海涅大学,哥廷根大学,莱布尼茨植物遗传与作物研究所,USDA-ARS

抽象

沙漠灌木种子,霍霍巴(辛蒙德木)是液态蜡酯的丰富,可再生来源,在化妆品和工业润滑剂中它们是重要的添加剂。 霍霍巴属于其自己的分类学家族,几乎没有遗传信息可阐明其系统发育。 在这里,我们报告了荷荷巴的高质量887 Mb基因组,它组装成具有26个蛋白质编码基因的23,490条染色体。 霍霍巴基因组的双子叶植物只有全基因组三倍体(γ)共有,而最近没有重复。 这些基因组资源与广泛的转录组,蛋白质组和脂质组数据相结合,有助于定义脂质合成和储存的异质途径和机制,为该分类学上分离的雌雄异株植物提供了缺失的进化史信息,并将支持改善荷荷巴油农学特性的工作。 。

使用Advion TriVersa NanoMate的NanoESI-MS / MS和UPLC-nanoESI-MS / MS方法用于分析荷荷巴油中的三酰基甘油。