线上研讨会

用于表征蛋白质同种型的自上而下/自下而上蛋白质组学

 
用于表征蛋白质同种型的自上而下/自下而上蛋白质组学

提出者: LjiljanaPaša-Tolić,博士,太平洋西北国家实验室环境分子科学实验室

描述: 获得完整蛋白质的扩展序列覆盖并表征多个翻译后修饰(PTM)位点可能带来关键的技术挑战。 在本次网络研讨会中,我们将介绍如何使用Advion的TriVersaNanoMate®和RePlay®技术,使用集成的自上而下/自下而上的方法解决这些问题。

我们展示了TriVersa NanoMate基于芯片的电喷雾电离(ESI)和馏分收集的功能如何用于分析同种型,使用ECD或CID进一步研究完整水平的靶蛋白,对收集的部分进行自下而上的蛋白质组学以获得自信蛋白质鉴定,对感兴趣的特定部分进行靶向MS / MS,并更好地表征PTM可能发生的位置。

我们还讨论了RePlay如何通过允许您查看完整蛋白质与观察到的肽之间的相关性来简化数据分析过程,即使您的样本有限。 使用RePlay,我们采用了在线消化策略和集成的自上而下/自下而上的方法。 这种技术允许您在完整运行和二次RePlay运行过程中实施LC-MS / MS消化,因此您可以看到观察到的母离子和消化离子之间的时间相关性以及MS / MS的MS / MS。碎片离子。