Publicación

Activadores sintéticos de la migración celular diseñados por aprendizaje automático constructivo

 

Hospital Infantil Universitario de Zúrich, ETH Zúrich

Resumen

El aprendizaje automático constructivo tiene como objetivo crear ejemplos de su dominio aprendido que probablemente exhiban propiedades similares. Aquí, se entrenó una red neuronal recurrente con las estructuras químicas de moduladores de migración celular conocidos. Este modelo de aprendizaje automático se utilizó para generar nuevas moléculas que imitan los compuestos de entrenamiento. Se sintetizaron dos diseños de máxima puntuación y se probó la actividad funcional en un ensayo de migración de células esferoides fenotípicas. Estas pequeñas moléculas generadas computacionalmente aumentaron significativamente la migración de células de meduloblastoma. Los resultados corroboran aún más la aplicabilidad del aprendizaje automático constructivo al diseño de novo de moléculas similares a medicamentos con las propiedades deseadas.

El análisis se realizó por TLC / MS utilizando el Advion exprensaion Espectrómetro de masas compacto (CMS) y lector de placas Plate Express TLC.