生物医学研究所（IRBバルセロナ）、スペイン
あなたの研究室の研究の焦点は何ですか？
私たちの目標は、IRBバルセロナの研究コミュニティとその同僚に、大きなタンパク質やDNAから小分子まで、幅広い生物種のMS分析のための最先端のツールと方法論を提供することです。 最終的な目的は、これらの分子のアイデンティティ、構造、他の分子との相互作用、および生物学的機能についての洞察を得て、ドラッグデザイン、タンパク質メカニズムの解明、およびバイオマーカーの検索を支援することです。 トップダウンプロテオミクスに特化した手法を実装しており、スペインにおけるこのMS戦略のパイオニアです。
中核施設として、さまざまな生物学的分子を扱う責任があり、メソッドを絶えず効率的に変更する必要があります。
TriVersaNanoMateはどのように機能しますか® あなたの研究目標と一致しますか？
もともと、TriVersaNanoMateを購入しました® 非共有相互作用分析のためのチップベースの直接注入モードでしたが、私たちはすぐにそれが私たちの研究の他の分野に適用できることを学びました。 TriVersaNanoMateを使用する前®、フラクションの収集に関連する手順は、苦痛で時間がかかりました。 TriVersaNanoMateを使用®、セットアップを変更したり、安定化によって時間を無駄にしたりすることなく、LC/フラクションの収集または注入を実行できます。 従来のナノエレクトロスプレーソースに典型的な問題は発生しません。
TriVersaNanoMateのXNUMXつの側面® 印象に残ったのは、LC互換性を備えた複雑なトップダウンサンプルを分析できることでした。 これらのサンプルをLCタイムスケールで分析することはできません。また、フラクション収集機能により、以前は不可能だった方法で分析することができました。
TriVersaNanoMateを誰に勧めますか® 彼らの研究のために？
TriVersaNanoMateを使用しています® 全てにおいて; 非共有相互作用、トップダウン、ミドルダウン、ボトムアップ、基本的な注入、フラクションコレクションに結合されたLC。 この機器は、さまざまなセットアップのすべてで役立ちます。特に、ソースを変更したり、安定したスプレーを待つ必要はありません。
システムの信頼性は、特にアプリケーション間で頻繁に変更する必要がある人にとって最大の利点の1つです。 貴重なサンプルが失われないことがわかっているため、スプレーセンシング機能は非常に価値があることがわかりました。
TriVersaNanoMateを使用した出版物やプレゼンテーションはありますか®?
出版物のハイライト
トップダウンおよびボトムアップ質量分析アプローチの組み合わせによるヒト精子プロタミンプロテオフォームの特性化
Soler-Ventura etal。 J Proteome Res、2020、19（1）、221-237。 DOI： 10.1021 / acs.jproteome.9b00499
トップダウンMSアプローチとプロテイナーゼK消化ベースのボトムアップMSアプローチを使用して、正常精子の個体における翻訳後修飾を含む精子プロタミンプロテオフォームプロファイルを特定しました。
その他の出版物
- Arauz-Garofalo etal。 トップダウンプロテオミクスによるプロタミンの特性評価：DBSCANによるプロテオフォーム同定の促進。 プロテオーム、2021年。DOI： 10.3390 / proteomes9020021
- Yero etal。 ザ・ 緑膿菌 基質結合タンパク質Ttg2Dは、ペリプラズム全体の一般的なグリセロリン脂質トランスポーターとして機能します。 Comm Bio、2021年。DOI： 10.1038/s42003-021-01968-8
- Molnar etal。 ヒストンコードリーダーPHDフィンガープロテイン7は、ショウジョウバエの遺伝子発現と悪性腫瘍の性に関連した格差を制御します。 Sci Adv、2019年。DOI： 10.1126 / sciadv.aaw7965
- ナダルらホモ二量体アンドロゲン受容体リガンド結合ドメインの構造。 Nat Commun、2017年。DOI： 10.1038 / ncomms14388
- Testoni etal。 グリコゲニンの欠如は、グリコーゲンの蓄積と筋肉機能の障害を引き起こします。 細胞代謝、2017年。DOI： 10.1016 / j.cmet.2017.06.008
- Izquierdo-Serra etal。 標的共有結合フォトスイッチを使用した内因性受容体と細胞興奮性の光学的制御。 Nat Commun、2016年。DOI： 10.1038 / ncomms12221
- Pujol-Pina etal。 AβオリゴマーのSDS-PAGE分析は、アルツハイマー病の研究に値します：ESI-IM-MSの魅力。 Sci Rep、2015年。DOI： 10.1038 / srep14809
- Saez etal。 PPhの影響3 新しい有機金属ルテニウム錯体の抗癌活性の部分。 J Inorg Biochem、2014年。DOI： j.jinorgbio.2014.03.002
- ボルグ他血漿設計免疫親和性カラムによる枯渇後の脳脊髄液中のタンパク質ダイナミックレンジのスペクトルカウント評価。 Clin Proteomics、2011年。DOI： 10.1186/1559-0275-8-6
