出版

ESKAPE病原体の液抽出表面分析質量分析

 

著者:バーミンガム大学、イギリス

抽象

ESKAPE病原体(エンテロコッカス・フェシウム, 黄色ブドウ球菌, 肺炎桿菌, アシネトバクター・バウマニ, 緑膿菌, エンテロバクター・クロアカエ)院内感染のほとんどの薬剤耐性感染症の原因となる臨床的に重要な細菌種を表します。 したがって、迅速な識別の必要性は非常に重要です。 以前の研究では、XNUMXつのESKAPE病原体のコロニーを直接分析するための液抽出表面分析質量分析(LESA-MS)の適合性が実証されています(黄色ブドウ球菌 & 緑膿菌)寒天上で成長します。 ここでは、LESA-MSを残りのXNUMXつのESKAPE種に適用します(E.フェシウム E745、 K.ニューモニエ KP257、 A.バウマニ AYE、そして E.クロアカエ S11)および E.faecalis V583(の近親者 E.フェシウム)およびの臨床分離株 A.バウマニ 最適化された溶媒サンプリングシステムを使用したAC02。 いずれの場合も、トップダウンのLESA MS / MSをタンパク質同定に使用しました。 個々の種のタンパク質データベースを検索することにより、24のMS / MSスペクトルから合計37のタンパク質が同定されました。 続いて、同定されたタンパク質のMS / MSスペクトルを、未知の同定の精度を決定する目的で、自動データ分析ワークフローで複数の種の複数のデータベースに対して検索しました。 24のタンパク質のうち、19はタンパク質および種レベルで正しく割り当てられ、79%の同定成功率に相当します。

LESA-MS は、Advion Interchim Scientific を使用して実行されました。® TriVersa NanoMate®.